新闻

化学科学,皇家化学学会的旗舰刊物,今天宣布,该文章

“密度矩阵重整化群成对密度泛函理论(DMRG-PDFT):在聚苊和聚乙炔单线态 - 三线态间隙,” P。夏尔马,诉贝纳莱斯,S。 KNECHT,d。 G。 truhlar和l。加格里亚蒂,化学科学10,1716年至1723年(2019)。 doi.org/10.1039/c8sc03569e   

已被选定为主题的收集最流行的2018 - 2019年的物理和理论化学的文章: 

//pubs.rsc.org/en/journals/articlecollectionlanding?sercode=sc&themeid=02ec2dec-e7e7-4d78-8411-7afb634a771a

     密度矩阵重整化群(DMRG)白色和1999马丁;陈和头戈登2002;毫安,KNECHT,凯勒,和2017年reiher]是一个变电子结构的方法在原理上汇聚成满配置相互作用(当一个增加的键尺寸 M)通过使用扫描算法来优化波函数的矩阵积状态表示。它允许使用约比常规CASSCF大六倍活性空间。但DMRG(如常规CASSCF)是没有外部相关性的后SCF计算能量不可靠的。在本文中,我们提出了一种廉价的方式,通过使用一对-密度泛函理论(PDFT),以计算从DMRG波函数开始动态相关能量。

     在里面 化学科学 本文中,我们采用这种新方法,称为DMRG-PDFT,来研究并苯类和需要活性空间比传统CASSCF方法的可行性限制大聚乙炔单 - 三重差距。结果匹配得相当好与最可靠的文献值,并且它们具有仅在初始DMRG波函数的压缩适度依赖性。此外,DMRG-PDFT是显著比添加额外的相关性来DMRG,如DMRG随后多引用微扰理论的其他通常应用的方式更实惠。

Structure of n-acenes and n-polyacetylene

(一个) n-acenes,(b)中 n-polyacetylene

     最近,我们的组应用了DMRG-PDFT方法游离碱铁卟啉,铁(P):

“铁卟啉与CAS,RAS多组态成对密度泛函理论,和DMRG活性空间,” C。周湖加格里亚蒂,和d。 G。的物理化学truhlar,日记 123,3389-3394(2019)。 doi.org/10.1021/acs.jpca.8b12479

在本文中,我们使用MC-PDFT计算的FE(P)具有四种状态的充满活力的顺序活性空间范围从6个活性轨道8个活性电子〜34个活性电子在35个活性轨道,而最大的活性空间只有负担得起的DMRG-PDFT。 DMRG-PDFT给出正确的基态时,不管活性空间的选择的,并且它提供了一个高效,准确的方法来对待的电子相关的像铁卟啉大分子。

     DMRG-PDFT的第三方应用将在短期内公布:

用p“在一个三 - hydroxobridged铬二聚体磁耦合发生通过与贯通空间耦合相结合的配体 - 介导的超交换”。夏尔马,d。 G。 truhlar和l。加格里亚蒂,予以公布。

     DMRG-PDFT计算与执行 openmolcas 8.3 基于软件包使用实施 qcmaquis 软件套件 openmolcas 8.3。进行计算,一个具有使DMRG功能,而编制。当一个安装 openmolcas 并能够DMRG,一个自动下载源文件和必要的库 qcmaquis.

 

2020年8月5日

Yinan Shu

链接的化学新闻部

我们高兴地祝贺博士。沂南舒,在我们的小组,谁刚刚被授予罗宾hochstrasser青年研究者奖一个博士后。知更鸟hochstrasser青年研究者奖由爱思唯尔出版的荣誉罗宾hochstrasser和支持年轻科学家创建的;它每年给一个科学家谁没有永久教授化学物理和年龄小于40岁的人工作。获奖者是由科学家组成的编辑委员会由五名成员组成的国际委员会选择 化学物理。教授罗宾hochstrasser是主编 化学物理 近40年;他在化学和生物医学研究和他的学生中激光器的应用的先驱是诺贝尔经济学奖得主艾哈迈德·泽维尔。

沂南舒出生于中国杭州,并在我们的2011年集团获得武汉大学化学与生物科学学士学位度,他密度泛函电子结构理论的工作,特别是对电子激发态,对理解复杂的光化学和光物理过程,对非绝热动力学算法和机器通过深层神经网络学习。他的谷歌学术页面

     //scholar.google.com/citations?user=UtZEpfMAAAAJ&hl=en&oi=ao

沂南赢得了ACS物理化学师青年研究者奖四月,所以这是在一段很短的时间他的第二个主要奖项。

2020年7月22日

Yinan Shu沂南舒,博士,博士后助理工作与试剂教授唐纳德·特鲁勒,已经获得物理化学的2020年青年研究者奖的美国化学学会分工。他的选择获得这一奖项,并将在未来的PHY研讨会提出他的研究四位研究之一。 

沂南获得了化学和来自中国武汉大学生物科学他的学士学位,他从密歇根州立大学博士学位。他的论文集中,“从第一原理的光电子材料的理解非辐射复合过程。“他与教授truhlar研究工作重点是了解在激励和应用机器学习分子和材料的复杂行为来解决理论化学问题。 

这条新闻文章由艾琳harvala为 化学新闻部.

2020年4月16日

我们很高兴能在新的岗位祝贺两组校友,他们将承担学年开始二○二○至二○二一年。君威卢卡斯宝,谁是我们小组的研究生2014年至2018年,谁现在是艾米丽·卡特一个博士后在普林斯顿大学,接受了位置,在波士顿学院化学系助理教授栗山,马。博士。思佳洞,谁是我们组一个博士后2017至2019年,谁是现在小组在芝加哥大学的朱利亚加利的一个博士后,已接受化学与化学生物学在东北部的助理教授职位大学位于马萨诸塞州波士顿。我们希望他们都好,我们有信心,他们将在自己的新岗位出类拔萃!

君威卢卡斯宝

君威卢卡斯宝

 

思佳洞

思佳洞

 

2020年3月24日

化学理论和计算的杂志出版了一本虚拟的问题纪念truhlar组和合作者的工作:

//pubs.acs.org/page/jctcce/vi/truhlar.html

在这个虚拟的问题荣幸的合着者​​是ahren碧玉,阿列克marenich,安迪·罗,安东尼奥·费尔南德斯·拉莫斯,贝基卡尔森,本janesko,王波,赵竹,克里斯·克拉默,东厦马,艾琳(dahlke)speetzen,EWA papajak,乔瓦尼李曼尼,乔瓦尼scalmani,汉娜leverentz,浩宇玉,叶普·奥尔森,晶晶正,约翰alecu,凯宁端木,柯杨,劳拉加格里亚蒂,卢卡斯宝,麦克弗里希,pragya维尔马,鲁meana-pañeda塞缪尔odoh,李少红升。李,史蒂夫杰罗姆,小何,徐雪飞,艳照,和鹰王。

二月6,2020

我们集团最近迎来博士后迪化吴和访问学生李袁曙宏到组。伴随着这一消息项目显示所有南开大学成员和组的成员过去的蒙太奇照片。左上角是南开大学教授李瑞芳,谁在1999年首次进入南开大学和谁在truhlar组第一南开大学参与者,在右上开始于2009年是benchen(凯文)黄,现在的研究生在芝加哥,谁在2015年进入南开大学,并在我们的小组在2018 - 2019年访问学生的大学。在书柜前是当前组成员,迪化武(左一,于2008年进入南开大学),嘉鑫宁(左二,在2014年进入南开大学,现在的研究生组中),不要truhlar(中),抒航李(右二,在2016年进入南开大学),以及杰宝(右一,该集团在2010年进入南开大学,现在的研究生)。

Nankai Alumni

 

2019年9月11日

皇家化学学会 告诉我们,我们小组的三篇论文都在对期刊的普通化学组合的高被引论文的前5%。成功的文章如下:

 

文章

被引频次在2018年

1

doi.org/10.1039/c6sc00705h 

“MN15:一科恩-假全球杂交交换相关密度与多参考和单参考系统和非共价相互作用,宽精度功能性”小时。秒。玉,X。他是。湖利,和d。 G。 truhlar,化学科学 7,5032-5051(2016)。

                    

59

  2

doi.org/10.1039/c7cs00602k

“变分过渡态理论:理论框架和最近的事态发展,” J。湖宝和d。 G。 truhlar,化学会评论 46,7548-7596(2017)。

 

23

3

doi.org/10.1039/c6sc05036k

“广义活性空间成对密度泛函理论:一种有效的方法来研究大,强相关,共轭系统,” S。戈什,C。学家克拉默,d。 G。 truhlar,L。加格里亚蒂,化学科学 8,2741年至2750年(2017年)。

                    

14

 

2019年7月31日

um在六月,我们集团很高兴地欢迎lyuben borislavov从她建议由教授牛逼索菲亚的索菲亚,保加利亚,在那里他建议由教授特别tadjer和托多尔dudev大学,并从高地印第安纳州,泰勒大学埃里卡·米切尔。布兰登马格斯。埃里卡制作的狄尔斯 - 阿尔德反应的多配置成对密度泛函理论和MC-PDFT解析梯度,由教授劳拉加格里亚蒂共监督并且还通过泰国斯科特,杰宝,和亚光辅助爱马仕的加速。 lyuben工作机器上的分子动力学轨迹为茴香硫醚的光解,由凯尔 - 帕克和沂南舒辅助学习。这两个学生提出了在2019年暑期大学生研究奖学金研讨会的CTC(冲浪座谈会)工作8月6日:在发言者 

  从索菲亚大学(保加利亚)lyuben borislavov,不要truhlar组 

  珍妮林从曼荷莲学院,马萨诸塞州,劳拉加格里亚蒂组

  玛利亚mikhailenko从圣彼得堡国立资讯科技机械与光学大学(俄罗斯),杰森古德帕斯特组

  埃里卡·米切尔从泰勒大学,印第安纳州,加格里亚蒂和truhlar组

  从卡尔顿学院,明尼苏达州,加格里亚蒂组克莱尔舒加特

  塞缪尔·鲍威尔从北俄亥俄大学,加格里亚蒂组

  维多利亚vernadskaia从圣彼得堡国立资讯科技机械与光学大学(俄罗斯),ILJA SIEPMANN组

  瑶吴从埃默里大学,佐治亚州,SIEPMANN组

座谈会后,在右边的图片拍摄所有的夏天研究人员在CTC冲浪程序,与参与导师和顾问一起。

 

2019年8月7日

postdoctroal assoicate景云你们就会开始在纽约州波茨坦市克拉克森大学在2020年一月在这里化学系助理教授是她的出版物清单,至今在truhlar组:

jacs1“通过催化NI-羟簇的金属 - 有机骨架内桥接氧化锆节点以形成杂双金属纳米线,” AE普拉特罗-普拉斯,AB联赛,诉贝纳莱斯,L C。gallington,一个。vjunov,纳米史怀哲,J。咋,J。筝,b。升梅迪,Z。李,AJ史蒂文斯,OK法哈,JT赫普,ND褐变,DG truhlar,JL富尔顿,JA lercher,DM卡马约尼,升。加格里亚蒂,CJ克拉默,千瓦查普曼,轴颈美国化学学会139,10410-10418(2017)。 

doi.org/10.1021/jacs.7b04997

 

jcatal1“单Ni原子和Ni4 簇具有相似的催化活性为乙烯的二聚,” J。你们,L。加格里亚蒂,C。 Ĵ克拉默,和d。克truhlar,催化354的轴颈,278-286(2017)。 

doi.org/10.1016/j.jcat.2017.08.011

 

 

 jcatal2“在乙烯的二聚活性和选择性MOF-负载的过渡金属催化剂的计算筛选,” J。你们,L。加格里亚蒂,C。学家克拉默,和d。 G。 truhlar,催化360的轴颈,160-167(2018)。 

doi.org/10.1016/j.jcat.2017.12.007

 

 

acscatal“合理化用于共双金属分子催化剂的反应性2 加氢,” J。叶河C。 Cammarota的,J。谢,米。诉福尔默,d。 G。 truhlar,C。学家克拉默,C。 C。吕和l。加格里亚蒂,ACS催化8,4955-4968(2018)。

 doi.org/10.1021/acscatal.8b00803

 

 

jacs2“超越活性位点:调谐金属 - 有机构架支持的镍催化剂的活性和选择性为乙烯的二聚,” J。刘,J。你们,Z。锂,钾。一世。大竹,Y。廖一。彼得斯小时。 NOH,天。 G。 truhlar,L。加格里亚蒂,C。学家克拉默,邻。法哈,和j。赫普,美国化学学会140,11174-11178(2018)杂志。 

doi.org/10.1021/jacs.8b06006

 

jpcc1J“上的金属 - 有机骨架,生长和Cu簇的扩散有机连接子效应”。你们,C。 Ĵ克拉默,和d。 G。 truhlar,物理化学杂志C 122 26987-26997(2018)。

doi.og / 10.1021 / acs.jpcc.8b09178

 

2019年2月17日

PCCP(皇家化学学会的物理化学杂志)的编辑们选择的纸张 

        “扩展哈密顿分子动力学:半经典轨迹具有改进的维护零点能的,”沂南枢,四甲秒。东,凯尔西一个。帕克,J。卢卡斯宝,linzao张,和Don truhlar,物理化学化学物理学20,30209-30218(2018)。 doi.org/10.1039/c8cp04914a

对于该主题集合“2018 PCCP热点文章”。

经典分子动力学是在物理化学上应用最广泛的仿真工具之一。在经典的分子动力学模拟一个长期存在的问题是经典力学不能维持零点能在振动模式。已经有许多尝试来克服这一缺陷,但没有实际的和完全令人满意的方法已经出现。本文介绍如何这个问题可以通过提出一个非常简单的扩展哈密顿驯服变向解决问题很长的路要走。纸张是广受关注,因为甚至可以应用到任何传统的仿真目前采用的最复杂的问题的方法。 

yinan

2019年2月6日 

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